秘密国家将山中博士（林寛 饰）洗脑，并借他的手向地球发射原子弹。钢铁巨人（宇津井健 饰）奋起阻拦，巨大的爆炸过后令所有人以为他随原子弹同归于尽。秘密国家喜出望外，其元首更发出了轰炸喜马拉雅山的指令。但是他的恐怖袭击并未使其他国家屈服，于是再次对纽约的摩天大楼、英国的伦敦塔和日本的议会厅进行轰炸。 　　另一方面，虽然薰（三ツ矢歌子 饰）、良一（池田輝久 饰）以及山中博士的助手浅见（浅见比吕志 饰）也被洗脑，但他们仍然保有自己的意志。经过一番商量，他们决定从内部粉碎秘密国家的阴谋。正邪双方终于到了决一死战的时刻……