主角建次与自己的父亲原本生活在史前时代生活，后来遇到了补捉时空怪兽的邪恶女王一行人与时空怪兽爱爱，后与跟父亲被邪恶女王变成化石流传到25世纪的日本，被双胞胎姊弟小柔与阿时发现，之后被时空王国的国王变回原形，奉时空管理局之命，抓回因为时空王国被攻击而流落到各个时空的时空怪兽。